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mega下载|MEGA进化树v7.378特别无广告版
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mega下载|MEGA进化树v7.378特别无广告版MEGA进化树是一款分子进化遗传分析软件,用于进行分析遗传学方面的研究,使用mega可以进行序列对比、进化树的推断、猜测分子进化速度、验证进化假说等操作,还支持通过nCBi进行序列的比对和数据的搜索,是一款容易好用的软件,就算您是菜鸟使用起来也没什么难度!
1、打开mega准备需要建树的序列,并将序列保存为fasta格式。
2、点击Align--Edit/built Alignment,选择Create a new alignment,点击ok。
3、打开fasta序列。
4、点击Alignment –Align by Clustalw ,选择所有序列,参数根据需求修改,选择【默认】,点击ok。
5、比对完成后,点击data –phylogenetic Analysis,出现坐标箭头指向的两个按钮。
6、点击phylogeny,有5个构建进化树的办法,一般选择MaximumLikehood(最大似然法)、neighbor-Joining(邻接法)和Minimum-Evolution(最小进化法)办法,在此选择选择neighbor-Joining(邻接法)建树。
7、在Test of phylogeny 选择Bootstrapmethod; no.ofBootstrap replications 输入2000; Mode/Method 核酸选择Maximum Composite Likehood, 氨基酸序列选择poisson model; Rates among sites 选择Uniform rates; Gaps/Missing data Treatment 选择Compeledeletion, 点击Compute得到下面后果,根据自己的需求对树进行修饰。
1、序列分析
系统发育推论
型号选择
约会和时钟
祖传国家
选择和尝试
序列比对
2、统计办法
最大似然
距离办法
普通最小二乘
最大的简约
复合似然
贝叶斯
3、强大的视觉工具
对齐/跟踪编辑器
树探索者
数据探索者
传奇发电机
基因复制向导
时间树向导
上述就是ylmfwin8小编给大家介绍的MEGA进化树v7.0.26 绿色中文版!
mega 使用教程
1、打开mega准备需要建树的序列,并将序列保存为fasta格式。
2、点击Align--Edit/built Alignment,选择Create a new alignment,点击ok。
3、打开fasta序列。
4、点击Alignment –Align by Clustalw ,选择所有序列,参数根据需求修改,选择【默认】,点击ok。
5、比对完成后,点击data –phylogenetic Analysis,出现坐标箭头指向的两个按钮。
6、点击phylogeny,有5个构建进化树的办法,一般选择MaximumLikehood(最大似然法)、neighbor-Joining(邻接法)和Minimum-Evolution(最小进化法)办法,在此选择选择neighbor-Joining(邻接法)建树。
7、在Test of phylogeny 选择Bootstrapmethod; no.ofBootstrap replications 输入2000; Mode/Method 核酸选择Maximum Composite Likehood, 氨基酸序列选择poisson model; Rates among sites 选择Uniform rates; Gaps/Missing data Treatment 选择Compeledeletion, 点击Compute得到下面后果,根据自己的需求对树进行修饰。
mega 特点
1、序列分析
系统发育推论
型号选择
约会和时钟
祖传国家
选择和尝试
序列比对
2、统计办法
最大似然
距离办法
普通最小二乘
最大的简约
复合似然
贝叶斯
3、强大的视觉工具
对齐/跟踪编辑器
树探索者
数据探索者
传奇发电机
基因复制向导
时间树向导
上述就是ylmfwin8小编给大家介绍的MEGA进化树v7.0.26 绿色中文版!
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